光合作用的演化史就是一部地球生命的编年史。最古老的光合作用证据可追溯到35亿年前的叠层石化石，这些由蓝藻（蓝细菌）形成的层状结构，是地球上最早的光合作用者。约24亿年前，蓝藻的大量繁殖导致了大氧化事件，彻底改变了地球的大气成分和矿物组成，也导致了当时绝大多数厌氧生物的灭绝。
内共生理论认为，约15亿年前，一个原始真核细胞吞噬了蓝藻但未将其消化，反而形成了互利共生关系，这个被吞噬的蓝藻最终演化成了叶绿体。这一事件为植物的诞生奠定了基础。从藻类到苔藓，从蕨类到裸子植物，再到1.4亿年前出现的开花植物，光合作用机制在不断优化中传播扩散，最终覆盖了陆地的大部分表面。
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